
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱动物 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究分析然而
研究分析职工探讨随食品冷藏库时期加大鸡肉的光洁度、持水功能、光亮感、散布态铁含碳量、ROS、脂质过氧化物质物、MDA、GSH和GPX4层次来评估报告腿部肌肉公司細胞核的铁意外死亡壮态。结杲表示,食品冷藏库时期加大后,鸡肉的光洁度在第四天和第6天明显急剧下降;持水功能降低;配色变深,有了光亮,鲜灰色换为暗灰色。前者,散布态铁、吸附性氧和MDA的含碳量明显加大,細胞核凋亡率明显偏高。 实验人群领取区别冷冻冷藏时段的肌肤样件的球核球蛋白酶质,第三开始SDS-PAGE解析,球核球蛋白酶质条带在区别时候规划竖直且类似于(图1a)。表明球核球蛋白酶在区别样件中的描述条件,解析发现了相同的组样件的中十位数将近于相同的能力(图1b),介绍肌肤样件球核球蛋白酶质含有积极的组内类似于性和组间差异化性。 核高核淀粉酶酶组学共监定出1996种核高核淀粉酶酶。以B0为比组,筛分B1、B2、B4和B6中的核核淀粉酶酶完成有地域差异 之处理解具体分享,共监定到374个DEPs。将火山图数据可视化,并会按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05二个标准规定具体分享DEP。成果右图1c-f如图所示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别监定出22、33、73和140个DEPs,进来分头别上涨6、11、32和83个,再降16、22、41和54个。聚类分析法技巧评价指标了有地域差异 速冻时期肌肤团体中核高核淀粉酶酶的理解,成果显视肌肤核核淀粉酶酶理解有地域差异 之处跟着吸收耗时的加强而加强(图1g)。
图1| 有所不同冷藏箱期限的相关肌肉样机蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各不相同保温事件的肌合格品距离球蛋白进行分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身亡蛋白质肽的PRM一定量浅析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 研究背景KEGG生物富集差异化传达蛋白酶的铁身故策略(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生态学提供了TMT降钙素原检测球高核蛋白组学能力工作性,拜谱生物工程已开发成功并树立了完美成长期的转录组学、球核蛋白组学、代谢率组学并且 多个学联动食品能力工作性保障体系,欢迎致电咨询!
选取学术论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.