在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

论述毕竟

1、从光敏塑造体细胞中分离出DNA交连淀粉酶质

想要分離光交连淀粉酶质-DNA混合物用到LC-MS具体分折，写作者搭建好几回种性变纯化措施，可从DNA中去要不是交连淀粉酶质，仅在灯照时确认同时DNA组接触性聚集DNA交连淀粉酶质。用TRIZOL提现染料质并快速清理落网获的非交连淀粉酶，那么将其如何水解以做好RNase助化解。确认超声清洗、剪切偶然所得淀粉酶质交连DNA的提现物，在硫氰酸胍中高温性变，并在二氧化反应硅离心力柱上激烈清洗以去要不是交连淀粉酶质就此来完成。确认核酸酶治理 从DNA中施放光交连淀粉酶，并做好胰淀粉酶酶助化解用到LC-MS具体分折。该具体方法起名为淀粉酶质交连DNA提现或XDNAX。

图1.蛋清质化学交联DNA领取或XDNAX程序图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可会直接相处DNA的核核苷酸图谱

将光化学交联手段APP于MCF7肿瘤细胞膜，出现 了1,805种备选血清，在其中1,191种具有于3个或更加次相同中。60%的DNA双方用途组有带核酸根据的GO批注，在由于缺乏核酸根据批注的血清质中，较大的业绩来自于核纤层血清，2是参与的脱色质组织化和肿瘤细胞膜裂开的血清质（图2）。

图2 . 可随便触及 DNA 的核胆固醇（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3归纳了DNA上下级间功能组所暗含的血清质-DNA接面试述涵盖的核苷酸热塑肽。这是指随着（1）球状DNA配合在一起形式域、（2）DNA 配合在一起起居不规律区（IDR）和（3）随着与某个血清质（譬如组血清配合在一起血清）、RNA（譬如剪接细胞因子）或相拆分区室（譬如核仁血清）上下级间功能而影响的自然环境达到。

图3 . 可简单使用 DNA的构成域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、化学发光法肿瘤细胞扰动这段时间内与DNA紧密联系的转录细胞因子

雌性雄皮质激素血清激酶α（ESR1）驻留到胞质溶胶中，是直到撞见其配体，引发易位到受损人体细胞系核，在什么地方它与遗传基因组中的相关区域环境通过以成功激活相关的转录系统。将血清饥饿的MCF7受损人体细胞系曝露于高用量雌性雄皮质激素（10 nM 17β-雌二醇）4分之五钟，与虚拟加工的剖析受损人体细胞系比效同旁内角的DNA彼此之间用处组（图4A）。其中的，雌性雄皮质激素的刺激后DNA彼此之间用处组中的ESR1曾加了30倍（图4B）。总的说，在1,814个一定量的血清质-DNA彼此之间用处中，约有9%显视出不低于2倍的明显變化，并留意到与ESR1都具有彼此之间用处的血清如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 女性激素药处里乳腺癌癌生殖细胞 DNA 相互之间使用组的化学发光法非常（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

总结ppt

探讨进行DNA组的血清质以熟知 它是怎么样去被读并付诸实践操作的，一直都在是科研开发者有一个长久的的要求。DNA组可及性主要的以DNA为中心站的的角度进行探讨，既使，到当下到止，染色剂质疑胶中的哪些方面血清质与DNA 进行数学能够 的影响尚不模糊。使用的零差距光交连，可发展DNA能够 的影响组中的一般数血清质，XDNAX技能将为血清质-DNA能够 的影响探讨的变强道具。

拜谱个人心得体会

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的核核苷酸组学、突显组学、分解代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

决定性医学文献：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.