草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿系统化性常用见的病毒的一种。肾结构中CaOx尖晶石过趋于稳定堆积会若想导至肾小管癌细胞受损和凋亡，若想若想导至肾结石的演变成。短链乳酸酸由胃肠腔内水解酸化池细菌病毒面团发酵营养饮食纤维棉诞生，不在轮廓线胃肠腔防御系统化中引领使用，并且在系统化性水平面上也引领重要使用。其中的，丁酸是最大量的短链乳酸酸，存在免疫细胞抑止和免疫细胞抑止使用,本探索浅议丁酸对CaOx肾结石的使用试述存在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山大医院泌尿整形科吴忠讲解、周子健博后于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠专家、周子健医学博士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网上药理学学服务性，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

本文公司名称：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 大家工作单位：华山的医院 理论研究物体：大鼠、HK-2癌细胞 分类信心：相较比较组（Con）、3d模型组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱给出水平：数据网络药学学测量

思绪方法图

研发然而

钻研考生前提是搭配大鼠仿真建模 ，实现生理方面血生化指标体系和企业病理学学刺绣等钻研法律手段发掘丁酸能能避免CaOx仿真建模 大鼠肾CaOx氯化钠晶体的达成和板材损害，改进CaOx仿真建模 大鼠的宫颈炎症板材损害和氧化物的物料的过多表明。虽然，丁酸还可阻止草酸帮助的HK-2受损内部板材损害、氧化物的应激性和受损内部凋亡。 为来探寻丁酸型式和靶遗传表观遗传遗传网格，科学研究员工从PubChem查看丁酸和丁酸酯的二维和三维空间型式（图1A）。顺利通过PharmMapper统计统计资料统计库和Uniprot统计统计资料统计库清理后共淘汰出117个丁酸靶遗传表观遗传遗传供进一个步骤探讨。将遗传表观遗传遗传目录引入STRING统计统计资料统计库，确定PPI网格探讨。Cytoscape给于了顺序的前20的核心区靶遗传表观遗传遗传的相信网格图，已经CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。等核心区遗传表观遗传遗传与网格中的一些遗传表观遗传遗传均展示出务必的涉及性，原因具体分析等遗传表观遗传遗传可能性树立着分工协用处处。GO和KEGG探讨呈现了丁酸核心区遗传表观遗传遗传的涉及有效有效途径和生物工程体学功能键（图1C）。核心区遗传表观遗传遗传主耍与类固醇刺雌激素对答、腐蚀应激性状态对答、生物工程氧神经细胞对类固醇刺雌激素畅快的电学响应已经对偏酸电学产物的电学响应关于。综合上面的提出的，等核心区遗传表观遗传遗传主耍进行了腐蚀应激性状态和对生物工程氧的生物工程体电学响应具体步骤，是肾结石变成管理机制中至关必要的有效有效途径，这阐明丁酸可能性在肾结石中树立必要用处。

图1| 丁酸构造与靶遗传基因无线网络讲解(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进1步探索丁酸对CaOx肾结石更何况切靶DNA，探索的人数巧用GEO数据报告库对GSE73680中营养健康比与CaOx肾结石病人的DNA差别参与了探索。比组与CaOx结石病人的偏态性好别展示DNA（DEGs）选择基准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个DNA会发生偏态决定，在这当中3379个（89.4%）DNA展示调整，404个（10.6%）DNA展示变动（图2A）。对DEGs参与聚类分析法确定分析确定分析，热图显现了前10个被选中DEGs的二维层次聚类分析法确定分析优点（图2B）。自后，探索的人数顺利通过GeneCards数据报告库人工服务认定了370个有可能与CaOx肾结石涉及到的DNA，网站排名前20位的預测DNA以及涉及到性评估右图2C下图。成了找寻到丁酸诊疗CaOx肾结石的关健靶点，探索的人数将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石涉及到DNA除理得以了一大个Venn图。进而，CYP2C9被确认为丁酸决定CaOx肾结石的内在靶点(图2D)。然而，探索的人数还参与了丁酸与CYP2C9的分子式联接，CYP2C9的四个碳水化合物残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸之间功效，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在用系统药剂学学預测CYP2C9是丁酸决定CaOx肾结石的靶DNA后，探究员工还能够 血人体细胞科学实验声明了CYP2C9可减小草酸引导的HK-2血人体细胞的ROS层次、慢性炎症板材损害和凋亡。

图2| 而言据库整合介绍预估CYP2C9是丁酸效果于CaOx肾结石的靶基因遗传

深入分析后果

本论述前提看到丁酸在身体外和人体内均能阻止CaOx肾结石3d模型的阳极氧化反应应激反应反应和慢性真菌感染问题，自后经由微信数据网络药剂学学淘汰收获丁酸干扰CaOx肾结石的隐藏的靶点——CYP2C9，还有经由神经元实验设计可确认CYP2C9在草酸盐成脂的HK-2神经元ROS总体水平、慢性真菌感染问题和凋亡。等看到表述丁酸有机会经由阻止CYP2C9来阻止CaOx肾结石的阳极氧化反应应激反应反应，解决慢性真菌感染问题。这些的时候中拜谱生物体工程供应了微信数据网络药剂学学技巧服務，不仅如此拜谱生物体工程可改善比较成熟改进的基因遗传组学、蛋白酶质组学、细胞代谢组学等多个学货品及技巧服務，欢迎图片拨通了解和咨询！ 选取文章：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.