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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抵抗能力种群非特异朋友、寡核苷酸呈现人工成本高涨或操作步骤程序较为复杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯院士团队图片在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个控制成本费用、跨鱼类、全app平台兼容的全新解决方案。

期刊杂志百科

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由国内合理合理院基因基因性规律与大物理学学调查所和国内基因基因性规律学好举办的國际科研讨论论文杂志杂志,锐意创新于消息自己生命合理合理和医疗基因基因性规律学方向的原創性调查效果。JGG 2028年度影晌要素7.1,Scopus科研讨论论文杂志杂志如何评价公式CiteScore 9.9,居首JCR 2028年度GENETICS & HEREDITY方向Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY方向Q1区,居首国内合理合理院论文杂志杂志设计布局物理学学大类目1区(Top论文杂志杂志),基因基因性规律学和生物技术化学与碳原子物理学学小类双1区。

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啥子是HEATag

幽默的“二三合一”设定

HEATag是由凝集素和HUH内切酶包含的融和淀粉酶

「固定器」板块 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化装饰(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「接器」功能 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)字段长形码对其进行共价接。

“1+1>2”的特效:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样版标志与朔源。

Fig1: HEATag多种标记图片目的关心图

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操作测试

HEATag应该有点能打?

行在有所不同具体条件下,建立喂奶部分动物癌肿瘤细胞系单癌肿瘤细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。科研开发团队为 HEATag 设计了多轮 “有压力测量”,从人体人体细胞系到人体人体细胞,从恒温到超高温,从新鲜样品到比较固定样品,全方法核验它的可信度性和可信度性。

首要轮检验针对于辅乳动物界受损上皮血细胞系:研究研究者考虑了发源人、鼠、仓鼠多个种类的五种受损上皮血细胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在室内温度下要 HEATag 图标后混合型喂养测序。最终能够出售的 11447 个受损上皮血细胞中,85.66% 都能顺利通过 HEATag 长条码精确性符合到原种类,样板间交叠严重污染非常少,UMAP 聚类算法研究往往是会直接认定书,HEATag 长条码与种类特女性朋友染色体组特点的高度一直。 接下来,测试软件状况进步骤升級:研发人士试试在 4℃下图标最新毛肚组织生殖神经元质、在制冷下图标甲醇不变组织生殖神经元质,因此会图标组织生殖神经元质核。没想到一如既往闪亮:大多数状况下,样例标签设计与种群个人信息均存在更好的关于性,分割精准的率超 95%。就算甲醇不变会造成 偶尔的转录本交叉点污染问题,组织生殖神经元质核配制也有一些 RNA 人才流失,组织生殖神经元质型号的注脚没想到一如既往与最新毛肚样例恢复相符,证明怎么写 HEATag 会图标各不相同清理状况下的调查样例。

Fig2: HEATag 可在有所差异要求下到位单细胞膜转录组混样剖析

都可以标记图片母乳喂奶动植物和海洋生物无脊椎骨动植物的原代细胞系

如何说肿瘤癌细胞系考试是 “依据题”,那公司样品就算 “附带题”, 许多样品不仅因肿瘤癌细胞种类僵化、大环境适用于性特异,加入标示技术性的 “要点”,而 HEATag 恰恰舞在许多 “要点” 上塑造了优劣势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸团体,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞一方面能被准确性分辩,所有一般组织细胞种类的聚类算法导致都清晰度可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海洋能生物学的匹配性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 方形码与植物物种转录组都具有较高完全独立性,还没有出現因高盐生活环境使得的 “记号出现异常”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可完成哺乳期间各种动物安排范例多种 scRNA-seq 剖析

Fig4: HEATag可满足丰富浅海无脊椎骨宠物重量 scRNA-seq 讲解

HEATag与细胞系的依照不懂带来转录组的可观变

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在顺利完成箭头目标任务的时,不能对事件调查的转录成分析构成干预,做到了论述数据信息的真實性。

Fig5: HEATag不想后果子样本的 RNA 表达出来传统模式

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未來可期

HEATag 能为单细胞系钻研带去些什么?

HEATag 的的价值,远不停于 “解决处理标出原因”,它的方便性和普遍性,尚未为单体细胞深入分析打开比较多能够性

从用画面来看看

HEATag 能覆盖率从 “简单的相比阐述”(如癌组织结构开发安排与正常的组织结构开发安排、性药物处里与比较)到 “大整体面积分析”(如组织结构开发安排组织图谱建模、高通芯片量建立)的全依据实际需求。随 PIP-seq、Stereo-cell 等轻型可拓展新技术的经济发展,HEATag 还能进每一步提高了单组织分析的通量,注力科研开发开发团队开发更多整体面积的建设项目。

从跨层面成长性来谈

HEATag 实际上适宜于转录组学,还能与表观DNA组学、血清质组学、房间组学等技巧性依照,利用定制化引索和寡核苷酸字段,HEATag 能否解乏加上多种的组学的流程,不反应数据捉捕层次。一同,来源于HEATag还能否开发单上皮细胞糖组学设计技巧性。

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的合作动向

拜谱生物工程与陈凯副教授完成分式的运算相互合作意料之外

需要点赞的是,在 HEATag 方法工艺突显出大应运潜质的题材下,拜谱怪物已与男方浮游生态学科学性与项目工程前力业务室(珠海)陈凯传授制定目标过程达成合作有意向。交易双方彼此行动计划紧紧围绕 HEATag 方法工艺的财产化落子、科学研究分析有效的转化等方向盘而铺展开的长度协同合作,助推这一种低人工成本、跨种类的单组织神经受损细胞图标方法工艺速度更快应运于实际的科学研究分析情况,为太多业务室提供数据快速、经济条件的单组织神经受损细胞研究分析交通工具,保驾护航科学研究分析业务者在组织神经受损细胞怪物学、浮游生态学怪物学、慢性病制度化等各个领域认定太多冲刺
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